"Data genom menunjukkan bahwa strain, atau varian, bakteri ini merupakan
nenek moyang dari semua malapetaka modern yang kita miliki saat ini di
seluruh dunia."
Sebuah tim internasional – dipimpin para peneliti dari Universitas
McMaster dan Universitas Tubingen di Jerman – telah mengurutkan
keseluruhan genom Black Death, salah satu epidemi yang paling
menghancurkan dalam sejarah manusia.
Ini pertama kalinya para
ilmuwan telah mampu merancang rekonstruksi genom dari setiap patogen
kuno, yang memungkinkan para peneliti untuk melacak perubahan dalam evolusi
dan virulensi patogen dari waktu ke waktu. Studi ini – yang saat ini
dipublikasikan secara online dalam jurnal Nature –
memberi pemahaman yang lebih baik tentang penyakit
menular modern.
Ahli genetika Hendrik Poinar dan Kirsten Bos
dari Universitas McMaster dan Johannes Krause dan Verena Schuenemann
dari Universitas Tubingen berkolaborasi dengan Brian Golding dan David
Earn dari Universitas McMaster, Hernán A. Burbano dan Matthias Meyer
dari Institut Max Planck untuk Antropologi Evolusi dan Sharon Dewitte
dari University of South Carolina.
Dalam studi terpisah yang
dipublikasikan baru-baru ini, tim riset mendeskripsikan pendekatan
metodologis terbaru untuk menarik keluar fragmen DNA kecil agen penyebab
Black Death yang terdegradasi, dan menunjukkan bahwa varian tertentu
dari bakteri pestis Yersinia, bertanggung jawab atas wabah yang
menewaskan 50 juta orang Eropa antara tahun 1347 dan 1351.
Setelah
keberhasilan ini, langkah utama berikutnya adalah mencoba untuk
“menangkap” dan mengurutkan keseluruhan genom, jelas Poinar, profesor
dan direktur Pusat DNA Kuno McMaster.
“Data genom menunjukkan
bahwa strain, atau varian, bakteri ini merupakan nenek moyang dari semua
malapetaka modern yang kita miliki saat ini di seluruh dunia. Setiap
wabah di seluruh dunia saat ini berasal dari keturunan wabah abad
pertengahan,” katanya. “Dengan pemahaman yang lebih baik terhadap
evolusi patogen yang mematikan ini, kita memasuki era baru dalam hal
penelitian penyakit menular.”
“Dengan menggunakan metodologi yang
sama, semestinya saat ini memungkinkan untuk mempelajari genom segala
macam patogen bersejarah,” tambah Krause, salah satu penulis utama studi
tersebut. “Ini akan memberi kita wawasan langsung tentang evolusi
patogen manusia dan sejarah pandemi.”
Keturunan langsung dari
wabah pes yang sama terus ada hingga saat ini, menewaskan sekitar 2.000
orang setiap tahunnya.
“Kami menemukan bahwa dalam 660 tahun
evolusi sebagai patogen manusia, terdapat perubahan yang relatif sedikit
dalam genom organisme kuno, namun perubahan-perubahan ini, betapapun
kecilnya, mungkin atau tidak mungkin diperhitungkan untuk mencatat
peningkatan virulensi kutu yang memporak-porandakan Eropa,” kata Poinar.
“Langkah berikutnya adalah menentukan mengapa ini sangat mematikan.”
Kemajuan
teknis utama dalam pemulihan DNA dan pengurutan telah secara dramatis
memperluas ruang lingkup analisis genetik spesimen kuno, membuka
cakrawala baru dalam pemahaman tentang infeksi yang muncul dan muncul
kembali.
Dewitte, Bos dan Schuenemann menganalisis sisa-sisa
kerangka dari korban yang terkubur dalam “lubang wabah” Smithfield Timur
di London, terletak di bawah lokasi yang sekarang adalah Royal Mint.
Dengan penargetan spesimen – yang telah dipindai untuk mendeteksi
kehadiran pestis Y. – dari pulpa gigi lima mayat, mereka mampu
mengekstrak, memurnikan dan memperkaya DNA patogen, sehingga mengurangi
DNA latar belakang yang terdiri dari DNA manusia, jamur dan non-wabah
lainnya.
Dengan menghubungkan penanggalan 1349-1350 pada kerangka
ke data genom, memungkinkan para peneliti menghitung usia nenek moyang
pestis Yersinia yang menyebabkan wabah di abad pertengahan. Penanggalan
ini menyatu suatu waktu antara abad ke-12 dan 13, menunjukkan bahwa
wabah sebelumnya seperti wabah Justinian di abad ke-6 – yang pernah
diduga disebabkan oleh patogen yang sama – kemungkinan disebabkan oleh
pantogen lain. Wabah Justinian tersebar di seluruh Kekaisaran Romawi
Timur, menewaskan sekitar 100 juta orang di seluruh dunia.
Jurnal: Kirsten I. Bos, Verena J. Schuenemann, G. Brian
Golding, Hernán A. Burbano, Nicholas Waglechner, Brian K. Coombes,
Joseph B. McPhee, Sharon N. DeWitte, Matthias Meyer, Sarah Schmedes,
James Wood, David J. D. Earn, D. Ann Herring, Peter Bauer, Hendrik N.
Poinar, Johannes Krause. A draft genome of Yersinia pestis from
victims of the Black Death. Nature, 2011; DOI: 10.1038/nature10549
Tidak ada komentar:
Posting Komentar